Waterschappen zijn, net als gemeenten en provincies, overheden met een algemeen en een dagelijks bestuur. Het dagelijks bestuur wordt het College van Dijkgraaf en Heemraden genoemd. Het algemeen bestuur draagt de naam: Verenigde Vergadering.
De voorzitter van zowel de Verenigde Vergadernig als het college van Dijkgraaf en Heemraden is de dijkgraaf. De Kroon benoemt de dijkgraaf voor een periode van zes jaar. De heemraden worden door en uit de Verenigde Vergadering gekozen. De leden van de Verenigde Vergadering worden elke vier jaar gekozen door inwoners uit het verzorgingsgebied. Het huidige bestuur is eind 2008 gekozen. De bestuursperiode loopt van 2009 tot en met 2012. Eind 2012 vinden nieuwe verkiezingen plaats.
De leden van de Verenigde Vergadering zijn verdeeld in drie adviescommissies met elk een eigen portefeuille. Hollandse Delta heeft de commissie Water, de commissie Waterkering, (vaar)Wegen en Vergunningverlening en de commissie Middelen, Bestuurlijke Zaken en Handhaving.
Wanneer er over een onderwerp een beslissing moet worden genomen, wordt deze vaak eerst voorbesproken in de betreffende adviescommissie. De commissie geeft dan over het onderwerp advies aan de gehele Verenigde Vergadering in de bestuursvergaderingen.
Bekijk hier het coalitieprogramma (pdf) voor de huidige bestuursperiode.